經過處理的種子播種后一般在20天陸續出苗，為培育壯苗，必須加強管理。防止日灼。幼苗剛出時，如遇高溫曝曬的天氣，嫩芽先端易枯焦或幼苗被壓彎，應及時將平鋪地面的塑料膜改為小拱棚，并經常觀測棚內溫度變化，保持棚內溫度不超過30c，濕度保持80%以上，當苗木大部分出土，應進行通風煉苗，逐漸撤掉塑膜。
間苗移苗。幼苗長到5―10cm時，要進行間苗定苗。為了培育壯苗，株距保持5cm左右，每畝定苗2―3萬株。間苗后的幼苗，可連土移到缺苗的地方，也可移到別的苗床培育，移栽時間以幼苗3―5片真葉時為好。在移栽前2―3天進行灌水，以利挖苗保根，陰天或傍晚移栽可提高成活率。隨采隨播苗木，于次年春季萌芽后進行間苗定株，使苗距保持在5cm左右。
中耕除草：中耕可疏松土壤，減少蒸發、雜草，防止土壤板結，有利于苗木生長。在苗木生長期內應中耕3―4次，使苗圃地保持土壤疏松無雜草。

即可出苗，苗木長出兩片芽葉時，氣溫逐漸轉暖，要及時破膜放苗，防止苗木彎曲在地膜內或被燙傷。放苗時注意用濕土把膜封嚴。放苗前地膜要破小口進行煉苗，以適應放苗后苗木在外界條件下生長。秋播播種溝深3―4cm。播種應根據種子質量確定，經過漂選的種子每畝帶動10―12kg。
下種量掌握在每畝（667平方米）100斤左右。將花椒種子放好后即可埋土，用人工將溝填平，一般埋土厚度在2-3厘米為好，埋土后耬平即可，采用以上方法種植的花椒苗一般20天后即可出苗，出苗后按正常苗期管理即可，一般當年苗高度可達0.5-1.5米，每畝出苗在2-3萬棵 。
花椒樹耐干旱瘠薄，特別適宜于梯田地、邊隙地、荒地、果園四周等栽植。科學栽植花椒樹也是改善生態環境、增加農民收入的有效途徑。初春土壤解凍后，將花椒樹根系周圍的土壤深刨30—50厘米，每株施有機肥30千克左右；4月中旬萌芽期、7月下旬采果后，每株各施標準化肥0.4千克。施肥后及時澆一遍透水。