工程預算審計以基建項目為標，包括資金來源、基建計劃、前期工程、征用土地、勘察設計、施工實施的一切財務收支；工程預算審核以單位工種為標的，只對單位工程預算的合理負責。 審計與工程預算審核是兩個截然不同的專業學科，審計以會計師、審計師為主；而工程預算審核以工程經濟和工程技術人員為主。目前 正在實行注冊造價工程師制度，今后的工程預算審核，將以造價工程師為主。

施工單位施工過程中對技術資料的未能完整歸檔或有意不建檔，造成建設單位在工程竣工后無法建立完整的工程資料檔案并按要求報送工程結算所需資料，從而使審計工作周期拉長、風險加大。這個問題也的確存在。不過，按照一般的情況，審計周期是按提供完整的資料開始計算的。除非你自己的要求沒有到位，那也怨不得別人。什么叫風險加大？是你審計費用不夠用了吧？既然做了審計這個行業，就要有這個思想準備，否則人家建設單位為什么出錢給你啊！建設單位缺乏工程技術專管人員和工程技術專業知識或工程技術人員職業道德水準不高，造成工程項目施工中不合規的變更簽證增多，從而使得工程預算隨意增大。

工程預算信息來源是工程投標的前提。信息來源途徑有： 1、主要依靠職工群眾的力量。 2、經常到建設市場獲取招標信息。 3、其他招標廣告媒體等。公司應組成專家組，對獲取的信息進行分析篩選。不能盲目的投入財力、人力等去奔波。 工程預算的簽證內容如下： 1、有經驗的承包商不可預見的惡劣的自然條件和非承包商人為障礙。 2、建設單位或監理工程師中的書面變更通知書。 3、建設單位或監理單位原因造成施工中斷和工效降低。

工程預算對分包工程進行全過程跟蹤審計是提高分包工程內審質量的主要途徑。本文主要通過對分包工程審計質量要素的分析，從內部審計的可操作性和務實角度，提出了在分包工程審計思路和方法，對分包工程內審質量的提高進行了探討。分包工程作為總承包工程的一個重要組成部分，對分包工程進行全過程跟蹤審計主要是以合同為主線，通過事前參與、事中監督、事后評價的全過程跟蹤，抓住招標競價、合同簽約、現場變更、材料供應、竣工結算等重點審計要素，實現對分包工程的全過程跟蹤審計。