固體廢棄物處理過程中，固體廢棄物所含的一些物質（包括污染物和非污染物）參與物理反應、化學反應、生物生化反應，生成新的污染物，導致二次污染。二次污染形成機理復雜，防治比一次污染更加困難。固體廢棄物處理過程中常見的二次污染物及其產生途徑有：

①長時間不當儲存與堆置過程中，廢棄物堆體滋生霉菌和寄生蟲等病原體，加速老鼠、蛇和蚊蟲等生物體的繁殖與生長，帶來疾病和疾病傳播危險；

②儲存、堆置、運輸、分揀、填埋等過程中，有機易腐物發酵腐爛過程產生甲烷氣、臭氣等大氣有害物和有機廢水（甚至含有重金屬和病原體等污染物）等土壤和水體污染物，同時也會滋生多種生物；

③焚燒處理過程中，固體廢棄物的有機氮、氯、硫等轉化成氮氧化物、氯化氫、硫氧化物等大氣有害物；

④焚燒處理醫療垃圾、生活垃圾等廢棄物過程生成二噁英，并產生大量的含重金屬、二噁英等污染物的飛灰（屬于危險廢物）；