由于養殖業廢水屬于高有機物濃度、高N、P含量和高有害生物數量的“三高”廢水。因此厭氧技術成為畜禽養殖場糞污處理中不可缺少的關鍵技術。對于養殖場這種高濃度的有機廢水，采用厭氧消化工藝可在較低的運行成本下有效地去除大量的可溶性有機物，COD去除率達85%～90%，而且能殺死傳染病菌，有利于養殖場的防疫。如果直接采用好氧工藝處理固液分離后的養殖業廢水，雖然一次性投資可節省20%，但由于其消耗的動力大，電力流水消耗是厭氧處理的10倍之多，因此長期的運行費用將給養殖場帶來沉重的經濟負擔。
  目前用于處理養殖場糞污的厭氧工藝很多，其中較為常用的有以下幾種：厭氧濾器（AF）、上流式厭氧污泥床（UASB）、復合厭氧反應器（UASB＋AF）、兩段厭氧消化法和升流式污泥床反應器（USR）等。近年來，厭氧消化即沼氣發酵技術已被廣泛地應用于養殖場廢物處理中，到2002年底我國畜禽養殖場大中型沼氣工程數量已經達到2000余處，是世界上擁有沼氣裝置數量多的 之一。雖然，在我國的沼氣工程建設中也不乏失敗的例子，工程建設成功率僅為85%，但這一技術不失為解決畜禽糞便污水的無害化和資源化問題的有效的技術方案。畜禽糞便和養殖場產生的廢水是有價值的資源，經過厭氧消化處理既可以實現無害化，同時還可以回收沼氣和有機肥料，因此建設沼氣工程將是中小型養殖場糞便污水治理的 選擇。