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工程預算材料費的計算要把好三關：“劃分界限關”――嚴格按規定劃分設備與材料。“價格關”――尤其是大宗材料和對造價影響較大的材料，要根據當地造價部門發布的材料指導價或通過市場調查、網上詢價等途徑，獲取材料的真實價格。“計算關”――審查材料費及運雜費計算的合理性和合規性。分包工程計價的審計。對分包工程預算進行合理準確的計價是真實反映分包工程預算的基礎，將工程量計算、定額子目套用及費率計取作為分包工程計價審計的審計重點。
工程預算中的工程結算審核，以施工承包合同為基礎．以承發包雙方發生的實物交易為依據，按照 或地方施工工、料、機消耗標準進行核算，對雙方有約束力。其工程結算審核結果可作為雙方結算的法律依據。審計定義為：由獨立的機構和人員檢查被審計單位的會計憑證、會計帳本、會計報表以及其他與財政收支、財務收支有關資料和資產，監督財政收支、財務收支是否真實、合法和有效的行為。審計的目的是加強對公有制投資者資金進行有效的控制，減少投資者濫用職權截留資金，轉移資金于小金庫，造成建設資金流失，實施違法違規行為。其職能是一種監督行為。
工程預算建筑規模有時也會不一樣。比如規劃許可證是10000平米，但是招標文件上是10500平米，中標了和你怎么填？填10500平米，那么就會合規劃許可證發生沖突，到時候也會領不了。因此如何判定是有意為之要具體分析。審計部門可能會對造價指標進行比較。如多層框架結構（不帶地下室）每平米為多少元。可有的時候，招標單位的建筑面積是按照測繪部門提供的數據，而預算的建筑面積的計算方法有的不能和其接軌，難免會產生誤差。那么，由此認為就提高了工程預算也是不妥的。
工程量清單計量一般是根據每月完成的合同內實物工作量經監理工程師簽認合格準予計量的工程細目，它有階段性、按實計量的特點。根據這個特點，應在過程中來進行控制，而不是依靠事后發現超計量以后再扣回。工程預算計量人員（工地監理組、指揮部或總監辦的工程部、計劃部）均應認真學習合同文件和招標文件中的計量條款，心中應明確哪些項目可以計量，哪些項目不能計量，屬于包含在其他工程項目中的內容（例如：涵洞計量是以延米綜合單價計量的，因此其挖基、回填、清淤、基礎墊層、出入口鋪砌等均不能單獨計量。
