工程預算審計主要針對工程項目決算的，在一個建設項目竣工完成，建設單位與施工單位結算工程款時進行的。工程預算審計就是工程預算審核（審價），是工程預算咨詢單位咨詢業務的一部分。受業主委托對其工程項目的概算、預算及結算等，依據現行 政策法規、計價依據及相關工程技術資料對送審造價的工程量、單價及取費等進行逐項審核。在運用工程量清單計價模式進行工程預算審計工作時，可以從以下幾個方面來進行：

嚴防利用分包工程項目之間交叉施工內容，多家分頭重復計算工程預算和虛增變更簽證。一個總承包工程，往往由多家分包單位施工，有些分包單位利用兩個或幾個單位交叉施工，或利用分包工程結算項目較多，結算力量薄弱，不清楚現場施工情況，對現場變更簽證辨別力差等原因，分頭多計工程量和現場變更簽證，造成工程量計算重復疊加，騙取額外工程價款。分包工程材料費的審計。對分包工程材料費的審計，重點是對分包工程材料的使用情況和費用計算進行審計。掌握分包工程材料使用情況。將分包單位領用的甲供材料數量與預算分析用量及施工圖紙設計量進行分析對比，嚴防甲供材料的超領和浪費，只有杜絕建筑材料的浪費，才能確保總承包方的經濟效益。

貴陽工程預算估算模型。基于BP神經網絡，構建公路貴陽工程預算快速估算模型。針對以往工程案例，開展估算研究，將工程特征定量化數值，設為Xij(i=123?n;j=123?n)，將相應的貴陽工程預算定額預算相關資料，設為yis(i=123?n;s=123...n)，不考慮市場價格調整。明確BP神經網絡結構系統參數，包括輸入層節點數m、輸出層節點數n、隱層節點數L。以Xij為輸入，以yis為輸出，開始神經網絡訓練，獲得新建工程的造價估算神經網絡，反向估算新建貴陽工程預算。以某省道一級公路和二級公路工程為例，其中一級公路使用的是瀝青混凝土路面，記為T19；二級公路使用的是水泥混凝土路面，記為T20，檢驗18個樣本貴陽工程預算數據，基于檢驗結果能夠了解，T19造價指數是0.98，T20造價指數為0.96，獲得預算資料如下：T19路面類型是半柔性路面；基層為水泥穩定碎石；底層材料為石灰土；路面結構為瀝青混凝土；面層厚度為15cm；基層厚度為14cm；底層厚度為10cm；T20路面類型是剛性路面；基層為工業廢渣穩定土；底層材料為石灰土；路面結構為水泥混凝土；面層厚度為12cm；基層厚度為16cm；底層厚度為12cm。將獲得的預算材料和表1資料進行對比分析，能夠明確T19工程特征定量化描述是T19=(3122262.5)，T20工程特征定量化描述是T20=(5473434.1)，將T19與T20，輸入到經過訓練的BP神經網絡中，獲得的結果為T19=(0.40290.40560.50050.4365)T20=(0.62770.61560.42900.5661)，經過反算，獲得貴陽工程預算資料預測值，其中V19=(481.7416.440.0046145.85)V20=(1185.8237.160.0033247.07)，預測的相對誤差O19=(1.61%4.65%4.15%1.40%)，O20=(3.76%3.67%5.70%1.84%)，由此能夠看出，基于BP神經網絡預測的貴陽工程預算估算精度。

工程預算建筑規模有時也會不一樣。比如規劃許可證是10000平米，但是招標文件上是10500平米，中標了和你怎么填？填10500平米，那么就會合規劃許可證發生沖突，到時候也會領不了。因此如何判定是有意為之要具體分析。審計部門可能會對造價指標進行比較。如多層框架結構（不帶地下室）每平米為多少元。可有的時候，招標單位的建筑面積是按照測繪部門提供的數據，而預算的建筑面積的計算方法有的不能和其接軌，難免會產生誤差。那么，由此認為就提高了工程預算也是不妥的。