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工程預算審計方法還有很多各有各的優缺點 ，要提高審計效率，關鍵是要會選擇。政府投資項目范圍廣泛 ，各項目的建設難度、標準也不一致。另外，政府工程經常受到人為因素和自然條件的影響，往往建設時間長，存在較多的設計變更和現場簽證 ，有的項目在審計時已經發生變化 ，甚至無法進行現場取證。這些因素決定了工程預算審計具有多樣性、復雜性和風險性。因此，選擇審計方法時，既要考慮不同的審計階段和審計內容，還要結合審計目標，注意審計方法之間的交叉使用和外部審計條件的許可，做到有的放矢、科學使用。
工程審計是控制工程預算的有效措施，它可以提高工程資金的使用效率，對整個工程項目起到了監督檢查的作用。隨著經濟的快速發展，我國開展的大型工程也相應的增多，工程項目審計在工程建設經濟活動中起了越來越重要的作用。我國在工程審計中也相應地借鑒了國外的一些先進的技術，通過科學有效的創新管理，不斷的豐富工程審計的項目和類型，推動了我國工程建設方面的重大發展。接下來我們具體討論工程審計在工程預算控制中的有效作用。
工程預算承包人按專業條款的約定時間，提交當月(或節點)完成形象進度，監理工程師(或甲方代表)在規定的時間內核實已完工程量。對合同范圍內的工程量和變更的工程量分別簽證認可。（2）承包人根據工程量檢驗認可的證明，編制當月(節點)的工程量完成統計報表(按合同要求)及月度(節點)工程價款結算書，提供進度款申請并附上與進度款審批有關的支持材料。報基建部門，由委托的造價咨詢單位確認。（3）對月度(節點)工程價款結算書進行審核，首先審核簽證記錄的真實性、合法性，然后核定確認工程量；審核工程所套定額或清單價是否與工程執行定額或清單子目相符，實物工程量與圖紙不符、施工情況與施工合同不符、施工用料發生變化
工程預算審計主要針對工程項目決算的，在一個建設項目竣工完成，建設單位與施工單位結算工程款時進行的。工程預算審計就是工程預算審核（審價），是工程預算咨詢單位咨詢業務的一部分。受業主委托對其工程項目的概算、預算及結算等，依據現行 政策法規、計價依據及相關工程技術資料對送審造價的工程量、單價及取費等進行逐項審核。在運用工程量清單計價模式進行工程預算審計工作時，可以從以下幾個方面來進行：
