分包工程竣工結算審計是分包工程全過程跟蹤審計的第三步，是對分包工程預算的終確定。分包工程預算的合理性和準確性，直接體現著分包工程的審計質量和審計成果嚴格復核結算工程量。對結算工程量要嚴格審查和準確計算，將工程量的計算及變更簽證的確認作為審計重點，注意工程量的重復和多計，增強對虛假變更簽證的辨別力。工程量的確定要依據施工圖和業主或建設單位簽發的公務通知單、設計部門的設計變更單。尤其對現場變更工程量的確認，嚴防只計增不計減，要把握住“在一般情況下，有增必有減”的原則，如果有增無減，就要查明原因。對野外偏僻的施工簽證，要有現場各級人員的簽認，否決“一言堂”簽證。

施工組織設計的工程預算編制依據 (1)計劃文件，包括 批準的基本建設計劃文件、單位工程項目一覽表、分期分批投產的要求、投資指標和設備材料訂貨指標、建設地點所在地區主管部門的批件、施工單位主管上級下達的施工任務等； (2)設計文件，包括批準的初步設計或技術設計、設計說明書、總概算或修正總概算、可行性研究報告； (3)合同文件，即施工單位與建設單位簽訂的工程承包合同； (4)建設地區的調查資料，包括氣象、地形、地質和其他地區性條件等結算過程其他注意事項結算的工程量以竣工圖為準，竣工圖不清之處，預算人員要得到工程管理中心的確認或到工地現場進行實地測量；尤其對圖紙未標注、規范無特別要求，現場實際施工又提高標準的項目一定要有現場工程師文件確認并符合工程合同要求后才能給予按實結算。

工程預算審計以基建項目為標，包括資金來源、基建計劃、前期工程、征用土地、勘察設計、施工實施的一切財務收支；工程預算審核以單位工種為標的，只對單位工程預算的合理負責。 審計與工程預算審核是兩個截然不同的專業學科，審計以會計師、審計師為主；而工程預算審核以工程經濟和工程技術人員為主。目前 正在實行注冊造價工程師制度，今后的工程預算審核，將以造價工程師為主。

建設單位經常會提出一些設計中沒有的要求，比如增加市政設施、擴大面積、設計標準等，這些要求的增加都會增加成本，使得實際造價超出預算。對編制投資預算的重視。投資預算是工程前期工作中的一個重要環節，是一個決策性的文件，是對建設項目經濟效果進行評估的重要依據。相關人員必須對預算編制的重視，在可行性報告批長沙工程預算建設單位忽視設計單位選擇，設計階段的招投標工作不能很好落實。目前，市政工程在選擇設計單位時，憑關系、靠情面等情況屢見不鮮，不僅影響市政工程設計的科學性，還由于設計人員技術水平和設計經驗的不足導長沙工程預算致工程造價控制成為空話設計人員在對市政工程進行設計的過程中，過于重視設計技術，對其中涉及到的經濟條件缺乏分析，忽視工程造價的高低，使得不能通過對設計方案的優化達到控制造價的目的設計過程和施工過程不能有效銜接。目前，我國很多設計人員普遍缺乏實際的施工經驗，對很多新技術、新工藝、新材料還不夠了解，導致在施工過程中變更圖紙的情況經常發生，增加設計費用。