工程預算審計方法還有很多各有各的優缺點 ，要提高審計效率，關鍵是要會選擇。政府投資項目范圍廣泛 ，各項目的建設難度、標準也不一致。另外，政府工程經常受到人為因素和自然條件的影響，往往建設時間長，存在較多的設計變更和現場簽證 ，有的項目在審計時已經發生變化 ，甚至無法進行現場取證。這些因素決定了工程預算審計具有多樣性、復雜性和風險性。因此，選擇審計方法時，既要考慮不同的審計階段和審計內容，還要結合審計目標，注意審計方法之間的交叉使用和外部審計條件的許可，做到有的放矢、科學使用。

工程預算編制過程中使用定額應注意的問題： 1、定額未計價材料 計算式如下：未計價主材單位價值=帶括號的定額含量*主材預算價格定額未列含量的主材； 定額未編列的主材定額含量=設計用量*（1施工損耗率）主材價值=定額未編列的主材定額含量*主材預算價格； 2、腳手架搭拆費 腳手架搭拆費按人工費的5%計算，其中人工工資費占25%； 腳手架搭拆費=工程人工費*5%;其中人工工資=腳手架搭拆費*25%。

工程預算由于間接費、利潤、稅金等各項費用，是按照工程的專業（土建、安裝、裝飾、市政、人防、園林等）和工程類別（即按照施工難易程度分一、二、三、四類）分別規定了取費標準，審查時應該注意以下幾個問題：審查取費標準是否與所用定額相匹配。在編制決算時，主體工程選用某專業定額，則取費標準必須選用與該專業配套使用的標準審查取費標準是否與工程類別相吻合。首先，根據工程規模及工程類別劃分標準表，確定工程類別；然后，審查是否按確定的工程類別計取費用。如土建工程與安裝工程的工程類別應分別按各自的工程類別劃分標準表確定。

工程量清單計量一般是根據每月完成的合同內實物工作量經監理工程師簽認合格準予計量的工程細目，它有階段性、按實計量的特點。根據這個特點，應在過程中來進行控制，而不是依靠事后發現超計量以后再扣回。工程預算計量人員（工地監理組、指揮部或總監辦的工程部、計劃部）均應認真學習合同文件和招標文件中的計量條款，心中應明確哪些項目可以計量，哪些項目不能計量，屬于包含在其他工程項目中的內容（例如：涵洞計量是以延米綜合單價計量的，因此其挖基、回填、清淤、基礎墊層、出入口鋪砌等均不能單獨計量。