目前，施工組織設計中普遍存在可操作性差、缺乏理論依據等問題。目前施工組織設計主要存在以下問題: ①施工組織設計的編制缺乏理論指導和依據標準，對施工組織設計的重要性認識不足，編制的施工組織設計內容不、不規范、不系統、可操作性不強； ②工程項目質量目標及保證措施的制定缺乏理論依據，忽視職業和環境目標指標及保證措施的制定，在編制施工組織設計過程中，重視工程項目的技術性，輕視其經濟性； ③沒有引入先進的管理模式，管理施工組織設計的編制和實施過程，施工組織設計的修改完善不及時，貫徹實施不到位，施工人員往往脫離施工組織設計，憑經施工，按習慣操作。 ISO9001認證要求對具體產品、項目或合同的實現過程進行策劃，策劃內容應包括： ①產品的質量目標和要求； ②針對產品確定過程、文件和資源的需求； ③產品所要求的驗證、確認、監視、檢驗和試驗活動，以及產品驗收準則； ④為實現過程及其產品滿足要求提供證據所需的記錄。 ISO14001認證要求組織制定環境目標指標，識別適用的法律法規，對組織活動、產品或服務的全過程，在考慮3種狀態（正常、異常、緊急）和3種時態（過去、現在、將來）下，識別和判定對環境具有影響的因素，尤其是重要環境因素，對其進行控制或施加影響，并把重大環境因素的改進作為環境目標指標加以考慮，制定相應的管理方案，或減少環境污染和資源浪費。 ISO45001認證要求組織制定職業目標，識別適用的法律法規，根據行業特點，針對具體工程項目，對所有進入作業場所人員的活動、常規和非常規的活動、正常和非正常狀態下的活動、作業場所內的所有設施、人為可預見的職業潛在事件或緊急情況等加以考慮，充分、地識別工程項目壽命周期內各過程的危險源，并對風險進行正確的評估與分級，確定不可容許的風險，確定重大危險源，并把重大危險源的改進作為職業目標加以考慮，制定相應的管理方案，明確控制危險源措施，事故和職業病的發生。上述三標準的要求可作為施工組織設計的理論依據。