在水產養殖環境中的作用穩固水體菌藻相平衡：碳是藻類十分重要的營養元素，相當于是藻類的骨架。向水體中補充含碳源的物質能夠補充有機碳，穩固水體菌藻相平衡，進而穩定水體的pH。例如很多水產養殖池塘中如果水中缺碳，藻類生長緩慢或者不穩定，補充像乙酸鈉這樣的碳源，可以為藻類的生長提供必要的碳元素，促進藻類的光合作用，增加水中的溶氧量；同時維持有益微生物在水體中的比例和活性，防止因天氣突變等原因引起水質的劇烈變化，起到穩定養殖水體生態環境的作用。促進有益微生物和藻類繁殖：水體中的碳源富含發酵蛋白、浙江衢州同城氨基酸和還原糖時，能有助于促進有益藻類和微生物的繁殖生長，穩定水色。水產養殖中的藻類可以為養殖生物提供氧氣、浙江衢州本地作為食物來源等重要作用，有益微生物則有助于分解水體中的有害物質、浙江衢州本地調節水體生態環境等，所以碳源通過促進它們的生長對整個養殖環境產生積極影響，如新生成的有益微生物能夠分解殘餌、浙江衢州糞便等，防止水中有機物的過度積累。

促進好氧生物處理,在好氧生物處理過程中，好氧微生物會氧化分解有機物，并且在這個過程中釋放能量。碳源的投加能夠滿足好氧生物對碳和能量的需求，從而促使好氧微生物大量生長和繁殖。例如在活性污泥法處理污水的工藝中，適量增加碳源，可以提高好氧菌群對污水中有機物的分解速度。好氧微生物可以將污水中的有機物，如糖類、浙江衢州當地蛋白質和脂肪等分解為二氧化碳和水。舉例來說，在城市污水處理廠中，通過向曝氣池中投加合適的碳源，可以使活性污泥中的微生物更快地分解污水中的有機污染物，從而加快廢水的處理速度，有效提高處理效率，使污水中的生化需氧量（BOD）等污染物指標迅速降低。