工程預算如果是預算結算承包，審計的重點是核查乙方提出的設計變更資料是不是通過了原來設計部門的同意或是經過了甲方的簽證，這里的重大設計變更有沒有計劃或者是主管部門的審批手續，變更工程量的計算是不是真實，套用定額與單價是不是合適且準確，設計變更的增減是不是同步，有沒有巧立名目、自行定價、搭車收費的現象。預算加系數或是平方米等價已經承包，審計的重點原則上已經把預算的變動，加價系數等算在內，因此不應該再零星項目變動經濟洽談。如果是招標承包，審計的重點是結算應該按中標合同的標價執行，當然遇到特殊復雜工程可以調價，也要有補充的合同，否則就不應該在 的結算關頭再另行加價。

承包工程合同簽定不規范，工程結算計價難以確定。工程預算在審計過程中發現，建設、施工雙方承包工程合同簽訂不規范。在簽訂合同時不按投標文件的內容逐一填寫，尤其是建筑規模和中標價，存在少填或者不填的現象，給工程計價取費留下活口，目的是為了竣工后高報工程結算價格打下伏筆，使得原本十分嚴肅的合同失去約束作用，建設單位失去了對施工單位工程報價的有效監督，容易造成決算價格偏高。同時，給工程結算造價審核帶來難度和風險。

工程預算的竣工具體要求： 1、工程已達到甲方竣工要求。 2、各個系統的功能說明，設備配備情況，以及圖例配備齊全，達到完整的竣工資料。 如何搞好竣工結算： 1、企業領導的重視。 2、編制人員具備各種工程的規范。 3、商簽公平合同條款，為結算編制提供必要條件。施工技術資料填寫質量要求：1、歸檔的工程預算應為原件。2、工程預算的內容及其深度必須符合 有關工程勘察、工程預算編制、施工、監理、等方面的技術規范、標準規程。3、工程預算的內容必須真實、準確、與工程實際相符合。4、工程預算應采用耐久性強的書寫材料，如碳素墨水，不得使用易褪色的書寫材料，如紅色墨水、純藍墨水、圓珠筆、復寫紙、鉛筆等。5、工程預算應字跡清楚，圖樣清晰，圖表整潔，簽字蓋章手續完備。

決策階段控制工程預算的方法一般有： 1）進行多方案的技術經濟比較，擇優確定 建設方案； 2）建立科學決策體系，合理確定投資估算； 3）客觀、認真的做好項目評價； 4）推行和完善項目法人責任制，從源頭上控制工程項目投資。 工程預算編制過程要注意以下幾點： （1）了解工程的設計文件、技術文件、現場勘查情況和施工條件。 （2）按國際清單要求設定清單項目 ，準確表述工作內容與工作要求，規范使用計量單位。 （3）清單項目設置完整，不漏項。 （4）工程量計算必須準確，不然給投標人實施不平衡報價以可乘之機。