工程預算審計主要針對工程項目決算的，在一個建設項目竣工完成，建設單位與施工單位結算工程款時進行的。工程預算審計就是工程預算審核（審價），是工程預算咨詢單位咨詢業務的一部分。受業主委托對其工程項目的概算、預算及結算等，依據現行 政策法規、計價依據及相關工程技術資料對送審造價的工程量、單價及取費等進行逐項審核。在運用工程量清單計價模式進行工程預算審計工作時，可以從以下幾個方面來進行：

施工企業為了增加盈余，就必須在預算造價范圍內，努力改善經營管理，提高勞動生產率，降低各種消耗。因此，建筑工程預算是施工企業加強經濟核算、考核工程建設成本的依據。施工企業編制施工計劃和統計完成工作量的依據。施工企業對所承擔的建設項目施工準備的各項計劃(包括施工進度計劃、材料供應計劃、勞動力安排計劃、機具調配計劃、財務計劃等)的編制，都是以批準的濟南工程預算為依據的。濟南工程預算有單位工程預算、單項工程預算和建設項目總預算。在單位工程預算的基礎上匯總所有各單位工程濟南工程預算，成為單項工程施工預算；再匯總各所有單項濟南工程預算，便是一個建設項目建筑安裝工程的總預算。單位工程預算包括建筑工程預算和設備安裝工程預算。建筑工程預算按其工程性質分為一般土建工程預算、水暖工程預算（包括室內外給排水工程、采暖通風工程、煤氣工程等）、電氣照明工程預算、弱電工程預算、特殊構筑物（水塔、煙囪和工業管道工程）等。設備安裝工程預算科分為機械設備安裝工程預算、電氣設備安裝工程預算和熱力安裝工程預算等。

合同管理是控制和協調的依據，也是經濟的法律手段，因此增強合同管理意識，完善合同條款十分重要。合同簽訂須交有關管理部門審查，并進行公證，以保證合同合理合法，保護雙方權益。條款的完備和內容的嚴謹，有利于減少合同糾紛，避免日后違約。實踐證明，項目法人與承包單位一定要加強合同管理，濟南工程預算及時糾正合同中存在的問題，保證合同的履行，提高投資效益。作為建設監理，確保合同條款的切實履行，是義不容辭的職責。設備、材料價款的控制設備費、材料費在建筑安裝工程中約占整個預算的70%左右，是工程直接費的主要組成部分。因此，在監理過程中，不可忽視這一部分，要引進競爭機制，開展設備、材料的招（投）標工作，濟南工程預算保證產品的質量，以降低工程預算。施工階段工程進度的控制實施合同管理，總的是質量、工期、費用三大控制。工程進度涉及到業主和承包人的重大利益，是合同能否順利執行的關鍵。為此，在工程進度監理中，一定要把計劃進度與實際進度之間的差距作為進度控制的關鍵環節來抓。除滿足工期要求外，還應滿足合同規定的工程質量及費用要求。質量、工期、費用三大控制，缺一不可，不能偏廢。必須抓緊、抓好，從而達到、經濟的工程施工的目的。

我國很多設計人員普遍缺乏實際的施工經驗，對很多新技術、新工藝、新材料還不夠了解，導致在施工過程中變更圖紙的情況經常發生，增加設計費用。設計費取費不合理。目前，很多市政工程的設計費用都是按照中標總價或者工程總預算的百分比收取的，設計過程中的資源浪費現象難以得到遏制，且對于資源浪費設計單位不承擔任何經濟責任，使得工程預算難以得到控制。積極采用招投標的方法選擇設計單位，在合同中明確要求設計人員對投資問題的重視，比如，在合同中可以規定，如果設計變更費用超出施工合同價的5%，就要扣除一定比例的設計費用。優化設計方案，控制工程預算。為了控制工程預算，設計人員要多拿出幾套設計方案由預算人員分析，預算人員要對其中涉及的影響因素從經濟角度進行深入分析，濟南工程預算以實現投資小化。比如某市政排水管線工程，原擬定新建691m長的D1800管道，其中30m需要進行頂管施工。后來，經過實際勘察，決定改變原有的設計方案，將D1800管道的長度縮減為558m，且不需要頂管施工，終節省工程費用近100萬元[。改變收費方法。在收取設計費用方面，要積極引入限額按比例提成的方法，促使設計單位與建設單位一同成本控制意識，進而實現成本控制目標。